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圖2.擴增曲線顯示了設置不當的基線 (A) 和設置正確的基線 (B)。
閾值的設置
Applied Biosystems?提供兩種閾值設置方法:自動和手動。自動設置中,軟件將自動選擇閾值,此閾值更適合平臺更高的曲線 (圖3中的藍色曲線)。然而這將導致此數據組中的紅色曲線的 Ct 值出現偏差,因為其至佳閾值比此值更低。通常情況下,默認設置通常已十分適當,但也可將閾值手動拖至指數期中間,以獲得更高的準確度。因此,需對每個數據組進行獨立研究,這樣才能根據具體情形選擇至佳閾值。
圖3.對數曲線屏幕截圖顯示了兩組曲線,它們的平臺高度和指數期不同。擴增曲線中確定 Ct 的至準確部分位于對數曲線指數期的中間。至佳閾值設置有時因各組數據的不同而異。
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